Dado su rol como institución regional que coordina y recauda fondos, MAR Fund se apoya de una manera especial en los miembros fundadores de cada país, para que sean éstos los que brinden la supervisión, el monitoreo y la evaluación a las entidades/beneficiarias. Los fondos nacionales existentes, con muy pocas excepciones, cuentan con las habilidades y la capacidad para llevar a cabo dichas funciones adecuadamente.
Fondo Mexicano para la Conservación de la Naturaleza, A.C. (FMCN) – México
Es una organización independiente, sin fines de lucro fundada en 1994. Tiene 20 años de experiencia financiando y supervisando proyectos de conservación. Durante los últimos 20 años el FMCN ha apoyado más de 1,000 proyectos por un monto total de más de 60 millones de dólares. FMCN recauda fondos principalmente de organizaciones internacionales y fundaciones privadas. La misión del FMCN es apoyar financieramente y fortalecer los esfuerzos de conservación y uso sostenible de la biodiversidad en México. Su visión es que México revertirá el proceso de deterioro de sus ecosistemas y la sociedad mexicana valorará su biodiversidad. FMCN garantiza a sus donantes y socios, el uso eficaz y transparente de los recursos..
Protected Areas Conservation (PACT) – Belice
Aunque es un país pequeño por su geografía y población, Belice es inmensamente bendecida con maravillas naturales. Reconociendo la importancia de su patrimonio nacional, Belice empezó a establecer su sistema de áreas protegidas en la década de 1960. PACT proporciona fondos para apoyar la conservación y promover la gestión ambientalmente racional de los recursos naturales y culturales de Belice para fomentar el desarrollo sostenible. PACT otorga financiamiento para proyectos y becas de capacitación para el manejo de áreas protegidas, la conservación, la promoción y el desarrollo, la educación y sensibilización ambiental, y desarrollo de las comunidades alrededor de las áreas protegidas. Desde su creación en 1996, PACT ha invertido más de $ 16.5 millones de dólares en las áreas protegidas de Belice.
Fundación para la Conservación de los Recursos Naturales y de Ambiente en Guatemala (FCG)
Se estableció en el año 2000 y ha manejado cerca de US$ 4 millones por medio de su variada estructura de pequeñas donaciones, subcuentas y microcréditos para apoyar las iniciativas relacionadas con las leyes y políticas ambientales, las áreas protegidas y el uso sostenible de los recursos naturales, entre otros. También administra los US$24 millones del Tropical Forest Conservation Fund, producto de un canje de deuda por naturaleza con los Estados Unidos. Los seis miembros del personal, consultores temporales y evaluadores externos de de FCG administran, monitorean y evalúan proyectos de conformidad con su objetivo general de promover la conservación de la biodiversidad, uso sostenible de los recursos naturales, gestión ambiental y adaptación y mitigación al cambio climático.
Fundación Biosfera (FB) – Honduras
Este fondo se estableció en el año 2002 y es un fondo ambiental constituido en Honduras. A la fecha ha administrado cinco proyectos locales financiados por MAR Fund y uno financiado por WWF en la Costa Caribe de Honduras; adicionalmente, apoya actividades del MAR Fund otorgando apoyo técnico y monitoreando los proyectos financiados por KfW a través MAR Fund en Roatán y Utila como parte del Proyecto Conservación de Recursos Marinos en Centroamérica. Se han hecho esfuerzos para establecer vínculos institucionales con organizaciones e instituciones locales, tanto públicas como privadas para ampliar el impacto de las actividades de conservación y protección de las áreas protegidas de la Región Atlántica de Honduras.