A principios del 2004, al reconocer la necesidad de un fondo regional y de una institución coordinadora, representantes de los fondos de conservación en cada país de la regiòn SAM (Belice, Guatemala, Honduras y México) iniciaron el Fondo para el Sistema Arrecifal Mesoamericano (Fondo SAM).
Fondo SAM es un fondo privado con una Junta Directiva integrada por donantes, expertos, la Comisión Centroamericana de Ambiente y Desarrollo (CCAD) y los fondos ambientales de cada uno de los países que componen el Arrecife Mesoamericano PACT (Belice), Fundación para la Conservación de los Recursos Naturales y Ambiente en Guatemala (FCG), Fundación Biosfera (Honduras) y el Fondo Mexicano para la Conservación de la Naturaleza (México).
La misión del Fondo SAM es impulsar financiamiento y alianzas regionales para la conservación, restauración y uso sostenible del Arrecife Mesoamericano.
Para llevar esto a cabo, el Fondo SAM opera como un organismo ecoregional de planeación y coordinación que prioriza proyectos y distribuye fondos. El Fondo para el Sistema Arrecifal Mesoamericano espera ser reconocido y respetado como un fondo confiable y transparente que es capaz de sostener y financiar alianzas transnacionales, políticas y prácticas efectivas orientadas a la conservación del arrecife mesoamericano y a promover la salud y el bienestar de los habitantes de la región.
MAR Fund desarrolla sus actividades a través de cinco programas:
- Salvando nuestras áreas protegidas: Un legado de cuidados. Establecimiento y protección de una red interconectada de áreas protegidas marinas y costeras prioritarias en la región.
- Pesca para el futuro: Pesquerías sostenibles para un arrecife próspero. Participación comunitaria en el co-manejo de sus pesquerías, establecimiento de zonas de restauración pesquera y monitoreo y protección de zonas de agregación de desove de peces.
- Cambio Climático: La necesidad es ahora. Apoyando adaptación al cambio climático y sus impactos en el arrecife.
- Fondo Marino de Belice: Mejorando la conservación marina en Belice con la participación de actores clave locales, para un beneficio regional más Amplio.
- Agua limpia para el arrecife. Mejorando el tratamiento de aguas servidas y el manejo de desechos sólidos para una ecorregión y su población más saludables.